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诺奖AI成果震撼开源!模型代码免费下载,或颠覆药物研发模式

【蜂耘网  人工智能】谷歌终于开源了万众期待的蛋白质预测模型——AlphaFold-3。

          

2024年11月11日,谷歌旗下公司DeepMind宣布,其最新版AI蛋白质结构预测工具AlphaFold-3正式开源,所有人均可下载其底层代码,并将其应用于非商业领域。

          

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AlphaFold-3有多重磅?

          

AI能够准确预测蛋白质结构真正广为人知,始于2021年DeepMind推出的AlphaFold-2,其能够根据氨基酸序列来准确预测蛋白质的三维结构。

          

AlphaFold-2的出现,引发了蛋白质结构及其相互作用建模领域的一场革命,为蛋白质建模和设计应用提供了广泛的可能。

          

此外DeepMind的 Demis Hassabis、John Jumpe 因对蛋白质结构的预测在今年获得了诺贝尔化学奖,AlphaFold-3是其最新版AI蛋白质结构预测工具。   

          

与前两个版本仅可以预测蛋白质结构不同, AlphaFold-3能够预测所有生命分子的相互作用。这相当于打开了整个生命科学研究的新大门,生命的基本过程被了解,直接推动了药物发现和疾病治疗。  

   

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AlphaFold-3的主要功能包括,能够对多种生物分子的结构进行预测,涵盖蛋白质、核酸(包括 DNA 和 RNA)、小分子、离子以及修饰残基等几乎所有在蛋白质数据库(PDB)中存在的分子类型。

          

在蛋白质结构预测方面,AlphaFold-3 展现出了极高的准确率,在预测蛋白质单体结构时,能够准确地确定蛋白质的三维折叠方式,以及三级结构中各个结构域的相对位置和取向。

         
AlphaFold-3在处理复杂结构方面表现出色,能够应对具有大量残基和多种分子组成的生物分子复合物。例如,在预测由数千个残基组成的蛋白质-核酸复合物结构时,它可以有效地整合蛋白质和核酸分子的信息,准确地构建出整个复合物的三维结构模型。对于具有高度对称性或重复结构单元的复合物,如核小体等,AlphaFold-3也能够准确地捕捉到其结构特征,包括组蛋白与 DNA 的相互作用、核小体之间的排列方式等。   

          

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因此全球顶级科学期刊《Nature》也进行了重磅推荐,这将对全球科研领域产生重大影响,生物、化学、医药的科学家们可以在本地部署AlphaFold-3,可以极限缩短新药、疫苗等研发进程,有望颠覆药物研发模式。

          

AlphaFold-3开源引起的狂欢

          

曾经在半年前,DeepMind团队在 Nature 期刊发表论文,描述了AlphaFold-3,但并未随论文公布其底层代码和模型训练权重,这一做法引起了科学家们的批评,如今谷歌终于开源AlphaFold-3模型。

          

谷歌本次开源非常非常低调,甚至都没有发布一篇新闻,只是在原来文章上进行了一段很小的文字说明:11月11日更新,我们已发布了AlphaFold-3的模型代码和权重供学术用途,以帮助推动科学研究。

          

尽管谷歌很低调,但还是引起了各界狂欢。   

          

Nature:“我们非常高兴看到人们用它做什么”AlphaFold-3终于开放了。

          

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GoogleDeepMind刚刚开源了AlphaFold-3模型,包括其代码和设置。它现在可用于学术用途!以最高的准确性预测各种生物分子相互作用🔹支持蛋白质-蛋白质、蛋白质-配体和蛋白质-RNA。

          

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很高兴地分享AlphaFold-3模型代码和权重现在可用于学术用途。期待看到这解锁了哪些新研究以及研究界如何建立AlphaFold-3。

          

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酷!谷歌刚刚开源了诺奖化学模型:AlphaFold-3能预测多种生物分子的结构,包括蛋白质、核酸(DNA和RNA)、小分子、离子以及修饰残基等。擅长处理复杂的生物分子复合物结构,能整合蛋白质和核酸分子的信息,构建出整个复合物的三维结构模型。   

          

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结语

          

谷歌DeepMind新推出的AlphaFold服务器是目前最准确的工具。只需点击几下,生物学家就可以利用AlphaFold3的强大功能对由蛋白质、DNA、RNA以及一系列配体、离子和化学修饰组成的结构进行建模。

          

以往实验性蛋白质结构预测可能需要大约一个博士学位的时间,并花费数十万美元。之前的模型AlphaFold-2被用于预测数亿个结构,按照目前的实验结构生物学速度,这需要数亿个研究人员年的时间。

          

可想而知AlphaFold-3带来的影响究竟有多大。AlphaFold-3的开源,让科学家不仅节省大量的金钱,也节省了大量的科研时间。所以科学家们也是大为兴奋,甚至已经在搓搓手期待怎么用了。

 

(蜂耘人工智能网  责任编辑:梅子)

2024-11-13 15:29

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来源:蜂耘网
谷歌终于开源了万众期待的蛋白质预测模型——AlphaFold-3。

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